黄振翘教授自上海中医学院（现上海中医药大学）毕业后仍孜孜不倦，悉心研读中医《内经》、《难经》、《伤寒论》及《金匮要略》等中医典籍，参阅历代中医学代表著作，由源及流，博览诸家之说。无论金元四大家，或清代叶天士、吴鞠通、薛生白、王孟英、何廉臣等名家著作无不用心，存细研究，且有阐发。凭籍他好学善悟的智慧，参合丰富的临床经验，撷取各家之精华，融众于一炉，形成了自己独到的学术思想。黄老常说：“熟读经典，可以感受中华民族历史文化的熏陶，通过熟读经典，可以掌握中医药学的思维方式、理论体系、辨证论治方法，从而指导临床、遣方用药。只有通过熟读经典，才有可能把握中医药的学术特点和文化内涵，进而吸纳现代科学技术成果，丰富和发展中医药。”黄老治病也以经典所论为据，如他对血液病出血的治疗，即是通过领悟《灵柩•百病始生》“阳络伤则血外溢，阴络伤则血内溢”之论述，提出了“脾肾气火相关”的理论。然《内经》未立具体治法，黄老则立“健脾益肾、泻火宁络”的治疗方法，以补《内经》所未备，说明黄老对典籍研究之精深。

黄老的医学理论，源于《内经》、《伤寒论》，在学术上恪守“茹古涵今，兼收并蓄，立足临床，重在创新”的治学思想。在长期的临床实践中不墨守成规，不因循守旧，师古而不拘泥，对前贤提出的理论、原则和经方能通过自身体验和不断总结加以补充或发挥，敢于突破，推陈出新，提出与众不同的新见解，以此发展了中医学理论，在学术思想上别具风格，尤对再生障碍性贫血的辨证与治疗更是独树一帜。提出再生障碍性贫血的病位虽在于脾肾，然其病机却涉及肝火伏热。黄老根据中医“肝肾同源”、“水火既济”理论，认为再生障碍性贫血因感受病邪，或情志伤肝，或劳损脾肾，终及肾水，阴损及阳；火热邪毒乘虚内伏少阴，耗伤肾精，以致肝木之火引发伏热邪毒乘于阴分，损及骨髓，耗伤阴精；肾阴亏则肝火失制，精血益损，脾气虚则肝火反侮、化源更乏。因此肾虚精亏是导致阴阳失调、生血障碍的根本原因，而肝火伏热是导致精亏髓枯、气血不生的病理基础。所以黄老在国内率先提出了著名的“补肾泻肝”治疗再生障碍性贫血的方法，获得了良好的疗效。并据此制定了一整套治疗再生障碍性贫血的方案，创制了系列成药，并通过实验研究证实了补肾泻肝法治疗再生障碍性贫血的作用机理。相关论文发表后，产生了较大的学术影响。

辨证论治是中医学的精髓。《内经》曰：“治病必求其本。”疾病的表现，有常有变，只有抓住疾病的本质，才能辨证求因，审因论治。“天下之病，变态虽多，其本则一，天下之方，治法虽多，对证则一。凡治病之道，必确知为寒，则竟散其寒，确知其热，则竟清其热，一拔其本，诸证尽除矣”。这里明确指出，疾病的发生是多种多样的，但只要辨证明确，抓住疾病本质，分清寒热虚实，便能有目的地用药。如寒证给予温散，热证投予清解，病因既除，则一切症状便会消除。临床上病情每在疑似之间，如“至虚有盛候”、“大实有赢状”、“阴证似阳”、“阳证似阴”、“真寒假热”、“真热假寒”等证，皆易误治。黄老认为此时须四诊合参，并借用现代医学技术，宏观以辨证，微观以借鉴，不可偏废。在掌握感性材料（四诊）基础上，通过抽象概括，察微见著，于小见大，从中掌握疾病发生、发展和预后转归的规律性，方可不为假象所惑。因而于临证之顷，善随机应变，熟练运用四诊搜集病史，辨别疑似，明察异同，作出正确的诊断，从而制定相应的治则、处方用药。黄老临证时常妙绪泉涌，着手生春，对奇难杂证，每获良效。如曾治一多发性骨髓瘤患者，自诉腰背两胁及低骼疼痛两年余，就诊时疼痛难忍，影响行动，面色苍白，低热神疲，舌苔薄少润，脉弦大而数。X 线摄片示头颅骨、骼骨多处均呈骨质疏松或鼠咬状骨质缺损，伴肋骨骨折、胸腰椎骨质稀疏脱钙；血红蛋白76 g / L ，血清蛋白电泳 γ球蛋白( IgG )63.6%，骨髓浆细胞明显增生23%，且有形态异常。黄老辨为肝肾阴虚、痰瘀互阻，经络之气失和：治以补肝肾，兼以化痰瘀、通络脉；药用狗脊、川断、补骨脂、白芍药补益肝肾，温宣痹阻；配赤芍药、桃仁、穿山甲、白花蛇舌草、白英活血解毒；陈胆南星、桑枝、徐长卿等化痰通络，患者服药两周低热已退，腰胁及背骶部疼痛明显好转，再予原方出入治疗两个月后，患者血红蛋白升到104g / L ，IgG 降至54.1%。1年后复查 X 线摄片：头颅、肋骨等骨质结构已基本正常。又如另一患者，头昏头痛多年，时伴耳鸣目眩，心悸寐差，全身酸软，疲乏无力以至发展到站立不稳。西医诊为神经衰弱，叠经中西药治疗罔效，慕名求治于黄老。黄老认为其证属肝肾亏损，脑髓失养，开始从补养肝肾入手，药用枸杞子、芝麻、熟地黄、菟丝子、牛膝、川断滋补肝肾；山栀、白蒺藜平肝木、清头目；蔻仁以避免熟地黄之腻滞；党参、白术健脾益气。患者服药后头痛头昏、耳鸣目眩减轻，原方去党参、白术、芝麻，加生龙骨、生牡蛎、浮小麦、远志，其重点在于益阴平肝潜阳。患者再诊时诸症均减，但仍有自汗恶风心悸，此时肝肾虽调，然营气失和，卫阳见虚，治以调和气血，固摄卫气。总以注重调整阴阳气血，以使阴平阳秘，气血调和，并抓住主要矛盾，分清先后，随机应变。患者前后服药1月余，症状渐除。由此可见黄老临床精于思巧，知常达变，其辨证论治水平达到了出神入化的境界。

黄老临证一丝不苟，制方严谨，用药精当，方随证变，灵巧活泼，方智圆神，因人因证而异，不拘门户之见，以疗效为准绳。其遣方用药、撷古采今、以轻灵取疗效，以重剂起沉疴，加减化裁，独具匠心，用药主张温而不燥，寒而不偏，滋而不腻，理气而不破气，活血而不动血，当补才补，不滥用补法，以防壅土而滞胃气，曾谓：读古人之书，宗名家之法，而不必拘泥于原来之方，要能师其意以切合具体病情，使之恰到好处。其对热性病的临诊用方，颇多创新之处。如暑湿之邪遏伏上焦气分，症见胸膈烦满，时或呕吵，常仿仲景泻心汤之苦辛开降法，然不用黄连、干姜，改用藿香配黄苓，取其微苦微辛以清上焦、再合用栀子豉汤、积壳、陈皮、桔梗等宣畅气机，清化上焦暑湿。

黄老对方药配伍的细微差别，用量多少之作用异同，皆有精辟的见解。诸如对四逆散、逍遥散、越鞠丸主治之异同，附子、肉桂、干姜配伍之差异，黄芩、黄连、黄柏等在应用上的微妙区别，都有自己的独到论见。黄老用药另一个显著特点就是选药时要考虑到一药多性，一药多用；善调肝木，相和五脏。如肝木克土，病及肝、脾、胃诸脏腑时，尽量选用既有利于疏肝领其血气，又有健脾和胃而无伤胃滞脾之弊的药味。因肝体阴用阳，性喜调达润养，脾主健运，性喜燥恶湿，故选方用药注意润燥得宜，刚柔相济。由于严谨立法，活泼用药，因而临床疗效可靠，为中医遣方用药增加了新的内容。