裘沛然在临床方面亦具有丰富经验，对于疑难杂症的治疗尤多心得。他所写的《疑难病证的中医治法研究》一文，是长期临床经验的总结，1987年获中华全国中医学会优秀论文一等奖。该论文总结养正徐图法，反激逆从法、大方复治法、内外贯通法、培补脾肾法、斩关夺隘法、随机用巧法、医患相得法等８种疗法，融哲理、医理为一炉，医界评之为“源于实践而高于实践”的佳作。

轻剂起沉疴“混沌”疗痼疾“假兼备以辜中，借和平以藏拙”这是清代医家叶天士对当时一些医生临症盲无定识，用药轻淡塞责的针砭之辞。袭沛然认为，叶氏之呵斥，确有必要，但他对上述两句话的含义另有新解。他指出，“兼备”与“和平”本非坏事，病情错综万变，往往虚实互见，寒热夹杂，治疗就应全面权衡，统筹兼顾，处方往往假“兼备”而获奇中，如果真正能用“和平”之品以起深痼则更值得称道。

他早年曾治疗一痢疾危证。患者一日痢下数十次，病延二旬，已濒危殆。中西医历治无效，已到不能进食、神识昏糊、脉微欲绝、四肢厥冷的险恶阶段。裘为之处一方，方中集补气温肾、清热燥湿、通里攻下、涩肠收敛及养阴等于一炉，似乎是一张“杂乱无章”的“兼备”之方，可谓“混沌而又混沌”。结果药后翌日即痢止神清，腹痛亦除，脉转有力，胃思纳谷，仅二剂而病痊，病家为之惊喜。说明“兼备”法并非杂凑成方，其中寓有缜密和巧思。

裘沛然认为，对治疗疑难危重病证来说，使用峻烈之品愈病，已经算是一位不错的医生，但总称不上良工。这是因为峻烈药品多伤元气，病虽得愈，体力暗耗，终究不是理想的治疗方法。如果能用性味平和的王道药物以解决问题，既去邪又不伤正，“平淡之中见神奇”，就比使用峻药疗病高明得多。他曾用玉蝴蝶、冬瓜子两味，轻起某些遍医无效的久咳水肿患者。一位晚期肝癌患者，医院已判定最多只能存活３个月，裘用平和的养正徐图法，培补脾肾，精心施治，竟然存活了10年（后卒于心脏病）。类似这样的验案虽然为数不多，但却弥可珍贵。

古方治今病，推陈出新意。

裘沛然十分重视古方的继承和发扬，诊务余暇，喜欢研阅方书，揣摩古人的医话医案，从中吸取营养，为现代临床服务。例如，他曾以乌头赤石脂丸合丹参饮，治愈因心阳式微，阴寒盘踞心胸，历时５年反复发作的胸痹；用红蓝花酒伍生脉饮加味治疗心阴亏损、血虚气滞的心痛；温经汤原为冲任虚寒、月经不调而设，抵当汤则主治太阳蓄血证，他把两方活用于治疗因寒凝瘀阻而致的心绞痛，使缠绵数十载的顽疾，得以控制；葶苈大枣泻肺汤专泻肺中痰热，用治心痛的报道极为罕见，他却以此方合桂枝生姜枳实汤，治疗一高年心痛患者，三诊痛止病愈，照常参加工作。

裘沛然经常对学生讲，运用古方治今病的关键在于“精熟”两字。学习古方必先领会立方原意，洞悉其中精微，才能融会贯通。临床上古方今病能够合拍者并不少见，在应用古方时，有时需把握主症即可以成方加减损益而奏效；有时则用古人原方而建奇功。组方有成法，用方要知常达变，而变化之妙，存乎一心。

既不离于法，又不为法拘。

在长期的医学生涯中，裘沛然经历了众多的各种复杂病证，从而体会到治疗疾病“既要不离于法，又要不为法拘”。他曾经治疗过不少各种类型的哮喘病，对其中属于寒饮咳喘之证，每以宣肺降气、温肺化饮、通阳散寒的常规疗法，而获痊愈或缓解。对《金匮要略》“病痰饮者，当以温药和之”之说，也有一定的体验。

然而1970年他治疗一痰饮患者，症见剧烈咳嗽，昼夜不停，气逆喘促，痰涎如涌，病程已历年余。病员体形肥胖，舌苔白腻，脉见沉弦。裘沛然先后用过温、化、宣、降以及涤、消、攻、逐诸法，也丝毫未瘥。不得已改拟黄芩、生地、龙胆草三味，大其剂量，与服２剂，竟奏意外之功。咳嗽十减其九，痰涌之象亦除，又续服数剂而病瘳。病家狂欢，他亦惊喜不置。病属寒饮，乃投苦寒而得手，实属“法外之法”。

立法处方用药，崇尚精奇巧博。

裘沛然根据自己多年临床的体验，觉得要提高疗效，可概括为“精、奇、巧、博”４个字。

处方贵精。所谓“精”即至当不易之谓。他在为心脏病患者治疗时，临床如表现为心阳不振，血行欠畅而见舌质淡胖，脉微细或结代者，常用炙甘草汤稍事加减，药后虽有效果，但常易反复，最后就迳用炙甘草汤原方，一味药不更动，只是在剂量上稍加斟酌，如甘草，桂枝，一般各用20克以上。有许多心脏病患者，曾屡更医生，中西药备尝，也曾服过炙甘草汤的加减方，均无良效，改服仲景原方后，不少病人症状竟得消失或基本缓解，有的历数载而安然无恙。于此可见古人立方之精。

立法宜奇。裘沛然经常说：“用药如用兵，兵法有堂正之师，有奇谲之法。用药之道，初无二致”。他自己有一次患感冒咳嗽，连续数天，旋即咳嗽昼夜不停，彻夜不能睡眠，不得已乃处一方，方用河子30克，黄芩30克，龙胆草9克，又加乌梅、干姜、细辛三药。药后２小时，吐出痰涎及食物残渣，隔半小时又大吐一次，是夜未进晚餐，即卧床安息，事出意料，这个昼夜不停的剧咳，竟得一吐而痊愈。后遇此类病证，他常用酸苦涌泄的吐法，亦每收奇功。可见奇方非偶致，多自教训中得来。

用药在巧。裘沛然善于从古代名医治病的经验中悟出其巧，面对复杂的病证，独出机杼而治愈顽疴宿疾，他对一些屡服中西药无效的支气管哮喘、消化性溃疡、心血管疾患、顽固性偏头痛、原因不明的高热、红斑狼疮、肝脏疾患等比较棘手的病症，别有一套辨治方法，但有时则往往在前医方中更改一二味，或略变动部分药物的剂量，使本来无法医治的疑难病证，进入逐渐转机的坦途。

关键在博。裘沛然认为，精、奇、巧三端均以“博”为基础，精源于博，奇不离正，巧生于熟。所谓“博”，就是要博览群书，博采众方。一个医生掌握的治病方法越多越好。如治眩晕，近人多囿于“阳化内风”及“无痰不作眩”之论，以天麻钩藤饮及半夏白术天麻汤等方为枕中鸿宝，殊不知肝阳不升、下焦虚冷、肾元亏损、气血两虚等皆可致眩，许多与此相应的古方，更是治眩所不废。医生胸中如有众多治法，才能在临床中泛应曲当而得心应手。